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COMENTARIO

The complete genome sequence of a chronic atrophic gastritis Helicobacter pylori strain: Evolution during disease progression Jung D y cols.
PNAS 2006; 103: 9999–10004.

Helicobacter pylori produce una gastritis superficial aguda en prácticamente todos los huéspedes humanos. Sin embargo, una parte de los individuos infectados desarrolla gastritis atrófica, una condición que se caracteriza en parte porque existe una disminución en el número de células parietales productoras de ácido y aumenta el riesgo de desarrollar adenocarcinoma gástrico.

Los autores de este trabajo habían realizado un estudio previo en ratones transgénicos gnotobióticos sin células parietales en el que habían demostrado que la perdida de células parietales permite a un aislamiento de H. pylori (HPAG1) de un paciente con gastritis crónica unirse, entrar y persistir en células gástricas. Estos hallazgos plantearon la cuestión de cómo la gastritis crónica influye la tumorogénesis, fisiología y evolución del genoma de H. pylori.

En este trabajo describen el genoma de la cepa de H. pylori HPAG1, cepa aislada de una mujer sueca de 80 años, que consiste en un genoma cirvular de 1.596.366-pb y un plásmido de 9.369pb. La cepa es tipo I con alelo s1b/m1 del gen vacA y cagA positivo. Posteriormente preparan un Affymetrix GeneChips con el 99.6% de las ORFs representativas de esta cepa para ser usado como método genotípico para caracterizar cepas de H. pylori obtenidas de pacientes suecos incluidos en un estudio de casos-control de cáncer gástrico y de gastritis cronica y de individuos que progresan de gastritis crónica a cáncer gástrico.

Los resultados muestran similitud entre cepas de pacientes con gastritis crónica, así como genes que se perdieron o adquirieron durante la progresión a adenocarcinoma. Encuentran 1.025 genes presentes en todas las cepas de pacientes con gastritis crónica y definen 121 genes como "asociados a gastritis crónica" entre los que se encuentran miembros de la familia HopZ, genes que ccodifican para cofactores que participan en el metabolismo del nitrogeno, azufre y carbono. El perfil transcripcional de genoma completo de la respuesta de la cepa HPAG1 al ácido durante el crecimiento in vitro indica que los genes asociados con la adaptación de H. pylori a la gastritis crónica son los que codifican para componentes de captación de metal, para rutas metabólicas, para proteínas de membrana externa y para factores de virulencia.

Comparan 2 cepas del mismo paciente que progresa a cáncer gástrico (cepas aisladas con 4 años de diferencia) y comprueban que la isla PAI se encontraba tanto en gastritis cró como en cáncer gástrico. Sin embargo hay genes que aparecen cuando el paciente presentaba cáncer gástrico incluyendo: D-alanina, d-alanina ligasa, metaloproteasa, metionil-tRNA formiltransferasa, y una ribonucleasa N y genes que desaparecen, incluyendo algunos implicados en reparación de ADN y una proteina de membrana externa.